蛋白互作是驗證基因或疾病作用機理不可或缺的一環，常用的檢測方法有：酵母雙雜、串聯親和純化、co-IP、FRET、熒光蛋白（螢光素酶）融合等。不同的檢測方法各有優勢，本期將介紹酵母雙雜的原理和優勢。

· 酵母雙雜的原理 ·
酵母作為一種真核生物，其基因的轉錄需要反式作用因子的參與。反式作用因子GAL4由DNA結合域（BD）和轉錄激活域（AD)組成，完整的GAL4能結合至啟動子上游順式作用元件并啟動轉錄，導致下游基因的表達。
在構建機制上，可將已知蛋白與BD構建為融合蛋白，將待測蛋白和AD構建為融合蛋白，若已知蛋白與待測蛋白存在相互作用，則兩者相互結合，導致BD與AD在空間上的距離非常相近，發揮完整的反式作用因子功能，啟動下游報告基因表達，可通過檢測報告基因的表達判斷蛋白的互作水平。
在實際應用中，通常有大量商業化產品直接使用，如AH109菌株，其既不能產生GAL4，又是Trp和Leu缺陷型菌株，無法在營養缺陷培養基中生長。當兩種配套載體所表達的融合蛋白能夠相互作用時，完整的反式作用因子能夠激活酵母中基因表達，使得酵母可在營養缺陷培養基上生長，達到篩選互作蛋白的功能。